Hét független kiadó pert indított az MP3.com ellen, szerzői jogainak megsértésével vádolva a céget. Az Emusic.com által New Yorkban indított perhez csatlakozott a Fearless Records, a Fuel 2000 Records, a Gig Records, az Invisible Records, a SpinART Records, és a Victory Records is. Az Emusic, mely 600 kiadó 13 ezer lemezének kizárólagos jogát birtokolja, azzal vádolja az MP3.com-ot, hogy jogtalanul engedte az Emusic lemezeinek online hallgatását felhasználói számára. Az MP3.com öt nagy lemezkiadóval már megállapodott lemezeik felhasználásáról, független kiadókkal azonban még nem tárgyalt.